Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA1P02647 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA1P02647 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA1P02647 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA1P02647 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA1P02647 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA1P02647 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA1P02647 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA1P02647 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA1P02647 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA1P02647 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA1P02647 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA1P02647 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA1P02647 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA1P02647 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA1P02647 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA1P02647 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA1P02647 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA1P02647 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA1P02647 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA1P02647 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA1P02647 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA1P02647 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA1P02647 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA1P02647 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA1P02647 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA1P02647 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA1P02647 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA1P02647 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA1P02647 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOA1P02647 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA1P02647 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA1P02647 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA1P02647 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA1P02647 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA1P02647 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA1P02647 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA1P02647 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA1P02647 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA1P02647 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA1P02647 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA1P02647 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms