Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-HP01893 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-HP01893 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-HP01893 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms