Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFP01375 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFP01375 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFP01375 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFP01375 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFP01375 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFP01375 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFP01375 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFP01375 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFP01375 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFP01375 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFP01375 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFP01375 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFP01375 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFP01375 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFP01375 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFP01375 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFP01375 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFP01375 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFP01375 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFP01375 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFP01375 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFP01375 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFP01375 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFP01375 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFP01375 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFP01375 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFP01375 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFP01375 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFP01375 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms