Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIMP1P01033 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP1P01033 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TIMP1P01033 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms