Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
F13A1P00488 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F13A1P00488 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
F13A1P00488 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
F13A1P00488 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F13A1P00488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
F13A1P00488 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F13A1P00488 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F13A1P00488 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
F13A1P00488 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F13A1P00488 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
F13A1P00488 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
F13A1P00488 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
F13A1P00488 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F13A1P00488 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F13A1P00488 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F13A1P00488 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
F13A1P00488 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F13A1P00488 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
F13A1P00488 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
F13A1P00488 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
F13A1P00488 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
F13A1P00488 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F13A1P00488 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F13A1P00488 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F13A1P00488 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
F13A1P00488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F13A1P00488 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
F13A1P00488 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
F13A1P00488 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
F13A1P00488 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
F13A1P00488 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
F13A1P00488 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
F13A1P00488 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
F13A1P00488 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
F13A1P00488 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F13A1P00488 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
F13A1P00488 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F13A1P00488 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F13A1P00488 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F13A1P00488 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F13A1P00488 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F13A1P00488 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F13A1P00488 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F13A1P00488 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F13A1P00488 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F13A1P00488 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F13A1P00488 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F13A1P00488 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
F13A1P00488 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
F13A1P00488 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
F13A1P00488 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F13A1P00488 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F13A1P00488 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
F13A1P00488 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
F13A1P00488 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F13A1P00488 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
F13A1P00488 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F13A1P00488 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F13A1P00488 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
F13A1P00488 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
F13A1P00488 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms