Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NSD2O96028 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD2O96028 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD2O96028 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD2O96028 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD2O96028 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD2O96028 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NSD2O96028 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NSD2O96028 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NSD2O96028 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD2O96028 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD2O96028 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD2O96028 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD2O96028 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD2O96028 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD2O96028 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD2O96028 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD2O96028 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD2O96028 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD2O96028 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD2O96028 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD2O96028 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD2O96028 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NSD2O96028 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NSD2O96028 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NSD2O96028 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NSD2O96028 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSD2O96028 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSD2O96028 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD2O96028 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD2O96028 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD2O96028 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD2O96028 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD2O96028 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSD2O96028 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD2O96028 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD2O96028 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD2O96028 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSD2O96028 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSD2O96028 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD2O96028 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD2O96028 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD2O96028 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD2O96028 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSD2O96028 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSD2O96028 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD2O96028 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD2O96028 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSD2O96028 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSD2O96028 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSD2O96028 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD2O96028 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD2O96028 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD2O96028 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD2O96028 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD2O96028 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD2O96028 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD2O96028 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD2O96028 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD2O96028 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD2O96028 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD2O96028 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD2O96028 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD2O96028 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD2O96028 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD2O96028 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD2O96028 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NSD2O96028 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSD2O96028 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSD2O96028 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms