Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL3O95573 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL3O95573 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSL3O95573 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms