Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24AO95486 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24AO95486 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24AO95486 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms