Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TRPM2O94759 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRPM2O94759 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRPM2O94759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM2O94759 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms