Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPP40O75818 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPP40O75818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPP40O75818 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPP40O75818 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPP40O75818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPP40O75818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPP40O75818 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPP40O75818 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPP40O75818 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPP40O75818 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPP40O75818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPP40O75818 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPP40O75818 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPP40O75818 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPP40O75818 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPP40O75818 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPP40O75818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPP40O75818 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPP40O75818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPP40O75818 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPP40O75818 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPP40O75818 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPP40O75818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPP40O75818 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPP40O75818 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPP40O75818 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPP40O75818 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPP40O75818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPP40O75818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPP40O75818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPP40O75818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPP40O75818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPP40O75818 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPP40O75818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPP40O75818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPP40O75818 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPP40O75818 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPP40O75818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPP40O75818 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPP40O75818 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPP40O75818 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPP40O75818 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPP40O75818 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPP40O75818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPP40O75818 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPP40O75818 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPP40O75818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPP40O75818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPP40O75818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPP40O75818 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPP40O75818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPP40O75818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPP40O75818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPP40O75818 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPP40O75818 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPP40O75818 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPP40O75818 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPP40O75818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPP40O75818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPP40O75818 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms