Protein–RNA interactions for Protein: O75695

RP2, Protein XRP2, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP2O75695 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP2O75695 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP2O75695 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP2O75695 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP2O75695 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP2O75695 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP2O75695 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP2O75695 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP2O75695 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RP2O75695 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RP2O75695 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RP2O75695 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RP2O75695 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RP2O75695 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RP2O75695 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RP2O75695 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RP2O75695 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RP2O75695 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RP2O75695 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RP2O75695 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RP2O75695 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RP2O75695 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RP2O75695 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RP2O75695 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RP2O75695 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RP2O75695 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RP2O75695 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RP2O75695 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RP2O75695 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RP2O75695 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RP2O75695 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RP2O75695 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP2O75695 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP2O75695 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP2O75695 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms