Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LGR5O75473 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGR5O75473 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGR5O75473 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGR5O75473 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGR5O75473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGR5O75473 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGR5O75473 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGR5O75473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LGR5O75473 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LGR5O75473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LGR5O75473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LGR5O75473 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LGR5O75473 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LGR5O75473 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LGR5O75473 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LGR5O75473 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LGR5O75473 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGR5O75473 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LGR5O75473 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LGR5O75473 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LGR5O75473 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LGR5O75473 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LGR5O75473 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGR5O75473 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGR5O75473 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LGR5O75473 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGR5O75473 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGR5O75473 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LGR5O75473 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LGR5O75473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LGR5O75473 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LGR5O75473 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LGR5O75473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LGR5O75473 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LGR5O75473 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LGR5O75473 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGR5O75473 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGR5O75473 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGR5O75473 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LGR5O75473 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LGR5O75473 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LGR5O75473 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LGR5O75473 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGR5O75473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGR5O75473 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LGR5O75473 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGR5O75473 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGR5O75473 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGR5O75473 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LGR5O75473 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGR5O75473 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGR5O75473 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGR5O75473 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGR5O75473 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGR5O75473 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR5O75473 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR5O75473 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGR5O75473 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR5O75473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR5O75473 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LGR5O75473 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR5O75473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR5O75473 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR5O75473 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR5O75473 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR5O75473 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR5O75473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR5O75473 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms