Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMPCBO75439 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PMPCBO75439 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMPCBO75439 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMPCBO75439 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms