Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRCH4O75427 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRCH4O75427 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms