Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA4O75335 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPFIA4O75335 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA4O75335 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms