Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF3O75054 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF3O75054 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms