Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2O75044 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRGAP2O75044 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRGAP2O75044 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms