Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTNND1O60716 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTNND1O60716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTNND1O60716 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTNND1O60716 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND1O60716 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms