Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPLO60437 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PPLO60437 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPLO60437 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PPLO60437 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PPLO60437 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PPLO60437 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PPLO60437 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PPLO60437 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PPLO60437 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PPLO60437 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PPLO60437 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PPLO60437 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PPLO60437 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PPLO60437 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PPLO60437 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PPLO60437 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PPLO60437 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PPLO60437 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PPLO60437 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PPLO60437 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPLO60437 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPLO60437 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPLO60437 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPLO60437 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPLO60437 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPLO60437 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPLO60437 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPLO60437 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPLO60437 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPLO60437 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPLO60437 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPLO60437 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPLO60437 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPLO60437 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPLO60437 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPLO60437 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPLO60437 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPLO60437 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPLO60437 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPLO60437 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPLO60437 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPLO60437 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPLO60437 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PPLO60437 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PPLO60437 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPLO60437 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPLO60437 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPLO60437 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPLO60437 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPLO60437 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPLO60437 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PPLO60437 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPLO60437 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPLO60437 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPLO60437 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPLO60437 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPLO60437 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPLO60437 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPLO60437 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPLO60437 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPLO60437 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPLO60437 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPLO60437 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPLO60437 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPLO60437 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPLO60437 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPLO60437 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PPLO60437 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPLO60437 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms