Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
URB1O60287 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
URB1O60287 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
URB1O60287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
URB1O60287 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
URB1O60287 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
URB1O60287 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
URB1O60287 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
URB1O60287 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
URB1O60287 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
URB1O60287 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
URB1O60287 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
URB1O60287 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
URB1O60287 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
URB1O60287 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
URB1O60287 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
URB1O60287 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
URB1O60287 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
URB1O60287 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
URB1O60287 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
URB1O60287 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
URB1O60287 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
URB1O60287 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
URB1O60287 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
URB1O60287 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
URB1O60287 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
URB1O60287 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
URB1O60287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
URB1O60287 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
URB1O60287 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
URB1O60287 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
URB1O60287 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
URB1O60287 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
URB1O60287 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
URB1O60287 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
URB1O60287 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
URB1O60287 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
URB1O60287 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
URB1O60287 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
URB1O60287 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
URB1O60287 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
URB1O60287 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
URB1O60287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
URB1O60287 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
URB1O60287 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
URB1O60287 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
URB1O60287 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
URB1O60287 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
URB1O60287 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
URB1O60287 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
URB1O60287 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
URB1O60287 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
URB1O60287 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms