Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11DO60235 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS11DO60235 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms