Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ORC4O43929 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ORC4O43929 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ORC4O43929 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ORC4O43929 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ORC4O43929 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ORC4O43929 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ORC4O43929 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ORC4O43929 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ORC4O43929 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ORC4O43929 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ORC4O43929 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ORC4O43929 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ORC4O43929 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ORC4O43929 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ORC4O43929 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC4O43929 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC4O43929 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC4O43929 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC4O43929 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC4O43929 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC4O43929 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC4O43929 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC4O43929 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC4O43929 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC4O43929 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ORC4O43929 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ORC4O43929 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ORC4O43929 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC4O43929 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC4O43929 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC4O43929 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC4O43929 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC4O43929 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC4O43929 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC4O43929 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC4O43929 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC4O43929 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC4O43929 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC4O43929 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC4O43929 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ORC4O43929 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ORC4O43929 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC4O43929 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC4O43929 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC4O43929 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC4O43929 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC4O43929 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ORC4O43929 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ORC4O43929 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ORC4O43929 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ORC4O43929 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC4O43929 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC4O43929 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC4O43929 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC4O43929 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC4O43929 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC4O43929 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC4O43929 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC4O43929 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC4O43929 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC4O43929 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC4O43929 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC4O43929 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC4O43929 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC4O43929 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ORC4O43929 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ORC4O43929 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ORC4O43929 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ORC4O43929 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC4O43929 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC4O43929 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC4O43929 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC4O43929 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC4O43929 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC4O43929 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC4O43929 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC4O43929 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC4O43929 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ORC4O43929 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ORC4O43929 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC4O43929 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC4O43929 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC4O43929 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC4O43929 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ORC4O43929 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ORC4O43929 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ORC4O43929 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ORC4O43929 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ORC4O43929 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms