Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDIL3O43854 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDIL3O43854 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms