Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATCO43716 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GATCO43716 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GATCO43716 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GATCO43716 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GATCO43716 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATCO43716 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATCO43716 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATCO43716 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GATCO43716 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATCO43716 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATCO43716 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GATCO43716 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATCO43716 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATCO43716 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATCO43716 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATCO43716 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATCO43716 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATCO43716 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATCO43716 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATCO43716 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATCO43716 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATCO43716 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GATCO43716 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATCO43716 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATCO43716 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATCO43716 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATCO43716 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATCO43716 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATCO43716 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATCO43716 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATCO43716 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATCO43716 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATCO43716 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATCO43716 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATCO43716 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATCO43716 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATCO43716 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATCO43716 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATCO43716 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATCO43716 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATCO43716 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms