Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN6O43657 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN6O43657 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN6O43657 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN6O43657 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms