Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBFA2T2O43439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBFA2T2O43439 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CBFA2T2O43439 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms