Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC8O43402 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC8O43402 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC8O43402 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC8O43402 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC8O43402 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC8O43402 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC8O43402 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMC8O43402 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMC8O43402 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC8O43402 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC8O43402 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC8O43402 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC8O43402 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC8O43402 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC8O43402 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC8O43402 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC8O43402 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMC8O43402 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC8O43402 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC8O43402 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC8O43402 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC8O43402 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC8O43402 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC8O43402 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC8O43402 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC8O43402 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC8O43402 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC8O43402 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC8O43402 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC8O43402 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC8O43402 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC8O43402 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC8O43402 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC8O43402 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC8O43402 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC8O43402 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC8O43402 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC8O43402 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC8O43402 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC8O43402 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC8O43402 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC8O43402 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC8O43402 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC8O43402 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms