Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODHO43272 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODHO43272 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODHO43272 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODHO43272 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODHO43272 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODHO43272 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODHO43272 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODHO43272 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODHO43272 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODHO43272 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODHO43272 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODHO43272 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODHO43272 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODHO43272 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRODHO43272 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRODHO43272 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODHO43272 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODHO43272 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODHO43272 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODHO43272 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODHO43272 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODHO43272 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODHO43272 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODHO43272 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODHO43272 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODHO43272 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODHO43272 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODHO43272 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODHO43272 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODHO43272 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODHO43272 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODHO43272 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODHO43272 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODHO43272 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODHO43272 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODHO43272 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODHO43272 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODHO43272 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODHO43272 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODHO43272 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODHO43272 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODHO43272 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODHO43272 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODHO43272 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODHO43272 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODHO43272 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODHO43272 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODHO43272 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRODHO43272 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODHO43272 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODHO43272 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODHO43272 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODHO43272 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms