Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIAH2O43255 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH2O43255 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms