Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26A1O43174 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CYP26A1O43174 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP26A1O43174 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP26A1O43174 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms