Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms