Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MID1O15344 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MID1O15344 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1O15344 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1O15344 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1O15344 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1O15344 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1O15344 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1O15344 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1O15344 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1O15344 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1O15344 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1O15344 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1O15344 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1O15344 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1O15344 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1O15344 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1O15344 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1O15344 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MID1O15344 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MID1O15344 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MID1O15344 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MID1O15344 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MID1O15344 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1O15344 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1O15344 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1O15344 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1O15344 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1O15344 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1O15344 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1O15344 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1O15344 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1O15344 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1O15344 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1O15344 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1O15344 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1O15344 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1O15344 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1O15344 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1O15344 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1O15344 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1O15344 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1O15344 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1O15344 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1O15344 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1O15344 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1O15344 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms