Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC1O14908 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIPC1O14908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms