Protein–RNA interactions for Protein: O14842

FFAR1, Free fatty acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR1O14842 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FFAR1O14842 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FFAR1O14842 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FFAR1O14842 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms