Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ASTN1O14525 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASTN1O14525 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASTN1O14525 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASTN1O14525 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms