Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2AP1O14519 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK2AP1O14519 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK2AP1O14519 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms