Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC1A7O00341 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A7O00341 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms