Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3CDO00329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3CDO00329 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3CDO00329 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3CDO00329 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms