Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DFFAO00273 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DFFAO00273 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DFFAO00273 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DFFAO00273 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DFFAO00273 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DFFAO00273 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DFFAO00273 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DFFAO00273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DFFAO00273 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DFFAO00273 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DFFAO00273 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DFFAO00273 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DFFAO00273 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DFFAO00273 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DFFAO00273 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DFFAO00273 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DFFAO00273 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DFFAO00273 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DFFAO00273 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DFFAO00273 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DFFAO00273 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DFFAO00273 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DFFAO00273 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DFFAO00273 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DFFAO00273 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DFFAO00273 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DFFAO00273 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DFFAO00273 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DFFAO00273 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DFFAO00273 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DFFAO00273 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DFFAO00273 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DFFAO00273 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DFFAO00273 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DFFAO00273 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DFFAO00273 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DFFAO00273 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DFFAO00273 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DFFAO00273 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DFFAO00273 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DFFAO00273 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DFFAO00273 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DFFAO00273 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DFFAO00273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DFFAO00273 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DFFAO00273 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DFFAO00273 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DFFAO00273 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DFFAO00273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DFFAO00273 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DFFAO00273 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DFFAO00273 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DFFAO00273 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DFFAO00273 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DFFAO00273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms