Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAPO00193 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAPO00193 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAPO00193 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAPO00193 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAPO00193 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAPO00193 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAPO00193 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAPO00193 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAPO00193 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAPO00193 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAPO00193 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAPO00193 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAPO00193 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAPO00193 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAPO00193 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAPO00193 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAPO00193 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAPO00193 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAPO00193 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAPO00193 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAPO00193 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAPO00193 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAPO00193 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAPO00193 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAPO00193 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAPO00193 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAPO00193 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAPO00193 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAPO00193 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAPO00193 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAPO00193 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAPO00193 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAPO00193 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAPO00193 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAPO00193 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAPO00193 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAPO00193 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAPO00193 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAPO00193 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAPO00193 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAPO00193 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAPO00193 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAPO00193 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAPO00193 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAPO00193 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAPO00193 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAPO00193 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAPO00193 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAPO00193 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAPO00193 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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