Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVH48-1M5A8F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVH48-1M5A8F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVH48-1M5A8F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms