Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KTA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KTA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KTA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KTA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
J3KTA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
J3KTA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KTA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KTA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KTA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KTA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KTA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KTA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KTA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KTA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KTA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KTA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KTA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KTA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KTA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KTA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KTA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KTA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KTA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KTA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KTA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
J3KTA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KTA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KTA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KTA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KTA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KTA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KTA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KTA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KTA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KTA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KTA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KTA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KTA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KTA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KTA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KTA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KTA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KTA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KTA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KTA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KTA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KTA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KTA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KTA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KTA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KTA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KTA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KTA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KTA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms