Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KRW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms