Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3BRM9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3BRM9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3BRM9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3BRM9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3BRM9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3BRM9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3BRM9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3BRM9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3BRM9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3BRM9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3BRM9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3BRM9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H3BRM9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3BRM9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3BRM9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3BRM9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H3BRM9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H3BRM9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3BRM9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BRM9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BRM9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BRM9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BRM9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BRM9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BRM9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BRM9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BRM9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BRM9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BRM9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BRM9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3BRM9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3BRM9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3BRM9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BRM9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BRM9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BRM9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BRM9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BRM9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BRM9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BRM9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BRM9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BRM9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BRM9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BRM9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BRM9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BRM9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BRM9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BRM9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms