Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNJ18B7U540 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ18B7U540 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ18B7U540 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ18B7U540 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms