Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHISA9B4DS77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHISA9B4DS77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms