Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DEV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DEV8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DEV8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DEV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DEV8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DEV8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DEV8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DEV8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DEV8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DEV8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DEV8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DEV8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DEV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DEV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DEV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DEV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DEV8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DEV8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DEV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DEV8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
B4DEV8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
B4DEV8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
B4DEV8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
B4DEV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
B4DEV8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
B4DEV8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
B4DEV8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B4DEV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DEV8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DEV8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DEV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DEV8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DEV8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DEV8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DEV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DEV8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DEV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DEV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms