Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KNCNA6PVL3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms