Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIIAD1A6NNX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIIAD1A6NNX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIIAD1A6NNX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms