Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM3A6NNA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms